Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDR2Q01850 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms