Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms