Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms