Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMF1P82094 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms