Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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VBP1P61758 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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VBP1P61758 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VBP1P61758 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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VBP1P61758 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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VBP1P61758 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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VBP1P61758 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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VBP1P61758 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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VBP1P61758 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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VBP1P61758 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VBP1P61758 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VBP1P61758 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VBP1P61758 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VBP1P61758 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VBP1P61758 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VBP1P61758 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VBP1P61758 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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