Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL23P55773 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL23P55773 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL23P55773 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms