Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HADHBP55084 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HADHBP55084 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HADHBP55084 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms