Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NDST1P52848 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDST1P52848 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDST1P52848 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDST1P52848 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms