Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUFMP49411 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUFMP49411 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUFMP49411 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms