Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK8P49336 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK8P49336 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDK8P49336 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms