Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTHFRP42898 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms