Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms