Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHB2P29323 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHB2P29323 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms