Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GJB2P29033 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJB2P29033 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJB2P29033 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJB2P29033 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJB2P29033 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJB2P29033 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJB2P29033 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJB2P29033 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms