Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRR2P28476 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms