Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLD1P28340 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLD1P28340 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms