Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms