Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TNCP24821 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNCP24821 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNCP24821 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms