Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BCKDHBP21953 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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