Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP4AP20648 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATP4AP20648 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms