Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms