Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TFE3P19532 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFE3P19532 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFE3P19532 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms