Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRAP18433 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRAP18433 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPRAP18433 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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