Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms