Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRF1P10914 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF1P10914 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms