Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CD28P10747 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CD28P10747 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms