Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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