Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms