Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SLC25A20O43772 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms