Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MTSS1O43312 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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