Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGSM2O43147 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms