Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms