Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms