Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKAB1Q9Y478 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAB1Q9Y478 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAB1Q9Y478 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms