Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3M1Q9Y2T2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3M1Q9Y2T2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3M1Q9Y2T2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms