Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GNEQ9Y223 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms