Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA3Q9XRX5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA3Q9XRX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms