Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TNRC6BQ9UPQ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNRC6BQ9UPQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms