Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM33Q9UPN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms