Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPK3Q9UPE1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK3Q9UPE1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms