Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN11Q9UMQ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN11Q9UMQ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms