Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EPDR1Q9UM22 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
EPDR1Q9UM22 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms