Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF490Q9ULM2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms