Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN2Q9ULH4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN2Q9ULH4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN2Q9ULH4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN2Q9ULH4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN2Q9ULH4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRFN2Q9ULH4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms