Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND2AQ9ULE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DENND2AQ9ULE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DENND2AQ9ULE3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DENND2AQ9ULE3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms