Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH7Q9ULB5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH7Q9ULB5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms