Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PILRAQ9UKJ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PILRAQ9UKJ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms