Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCTN4Q9UJW0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCTN4Q9UJW0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms