Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIMS3Q9UJD0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIMS3Q9UJD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms