Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM8Q9UJA3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM8Q9UJA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM8Q9UJA3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms